Православие пришло в языческую Литву извне. В 988 году Киевская Русь приняла христианство, и хотя этот процесс не был мгновенным, свет Христовой веры начал постепенно озарять земли Древней Руси. Однако в Литве всё было иначе: здесь языческие традиции были глубоко укоренены и оказывали стойкое сопротивление новой вере.
К моменту проникновения христианства на литовские земли уже произошло великое разделение Церкви на православную и католическую. Вместе с этим разделением появилось и соперничество, что определило сложный путь развития Православия в Литве. Христианство сюда проникало с двух сторон: с востока — из православной Руси, и с запада — из католической Польши и Ливонии.
Известный историк Г.Я. Киприянович, ссылаясь на летописи епископа Петра Камеранского, утверждает, что православие в Литве появилось уже в XI веке. Русские князья предпринимали походы в литовские земли, строили укрепления для сбора дани, тогда как литовские дружины неоднократно совершали набеги на русские территории. Эти постоянные контакты способствовали проникновению и утверждению христианской веры.
До XIII века Литва представляла собой раздробленное княжество, где правили независимые князья, часто враждовавшие друг с другом. Этим воспользовались Тевтонский орден и немецкие рыцари, подчинившие большую часть литовских земель. Чтобы сохранить независимость, свободные земли объединились под властью великого князя Миндаугаса.
Миндаугас, стремясь укрепить свои позиции и получить поддержку Руси, в 1246 году принял православие. Однако его выбор был скорее политическим шагом, чем искренним духовным обращением. Позднее, ради союза с Западной Европой, он принял католичество, не отказываясь окончательно от языческих обрядов.
Сын Миндаугаса, Вайшвилкас (Войшелк), известный в молодости своей жестокостью, впоследствии испытал духовный переворот. Познакомившись с православным игуменом Григорием в городе Холме, он принял крещение и вскоре полностью посвятил себя монашеской жизни. В 1261 году он основал Лавришевский монастырь на берегах Немана, где вел аскетическую жизнь. Однако историческая необходимость заставила его оставить монастырь — с 1264 по 1267 год Вайшвилкас возглавлял Литовское княжество, оставаясь верным православной вере.
При князе Гедиминасе (1316—1341) границы Литвы значительно расширились за счёт белорусских и украинских земель. Хотя сам Гедиминас оставался язычником, он проявлял удивительную веротерпимость: разрешал строить православные храмы, позволял крестить своих детей и заключал брачные союзы с русскими княжнами.
Особую роль в развитии Православия сыграл сын Гедиминаса — князь Альгирдас (1345—1377). Женившись на витебской княжне Марии Ярославне, он благоволил к строительству православных храмов, среди которых церковь святой Параскевы-Пятницы в Вильне. Однако в 1347 году, под давлением языческих жрецов, Альгирдас предал казни троих православных мучеников — Антония, Иоанна и Евстафия. Они отказались участвовать в языческих обрядах, за что были повешены. Их стойкость и преданность вере сделала их христианскими святыми, а их мощи стали объектом почитания.
После смерти Альгирдаса его сын Ягайло (1377—1392) женился на польской королеве Ядвиге и ради польской короны принял католичество. Это стало переломным моментом в истории Литвы: католичество было объявлено государственной религией, а православные стали подвергаться ущемлениям и ограничениям.
Ситуация ухудшилась после заключения Люблинской унии в 1569 году, объединившей Литву и Польшу в единое государство — Речь Посполитую. В 1596 году на Брестском соборе была провозглашена Уния, призванная объединить католиков и православных под главенством Папы Римского. Однако православное население восприняло её как насильственную и отвергло.
В этот сложный период важнейшую роль в сохранении православной веры сыграли братства, такие как Виленское Свято-Духовское братство. Они поддерживали храмы, издавали богослужебные книги и оказывали помощь нуждающимся. Свято-Духов монастырь в Вильнюсе стал центром духовного сопротивления. Когда почти все православные храмы были переданы униатам, именно Свято-Духов монастырь остался последним оплотом Православия.
Лишь в 1839 году, благодаря усилиям Иосифа Семашко, более полутора миллионов униатов вернулись в лоно Православной Церкви. Это событие было отмечено торжественными богослужениями, а в память о нём была отчеканена медаль с надписью: «Отторженные насилием (1596) — воссоединены любовью (1839)».
Сегодня Литовская православная епархия бережно хранит свою многовековую традицию, стремясь к миру и согласию с другими христианскими конфессиями. Её миссия остаётся неизменной: нести свет Христова учения, учить добру, милосердию и духовному единству.